Salve,
Com problema ao especificar o valor do frete para o Pagseguro, demorei mas consegui. Infelizmente a documentação não deixa de forma clara. Então segue a dica:
Na configuração do frete no painel do Pagseguro, escolha o tipo Frete fixo e Adicional com valor fixo informe 0 ( zero ) para o Valor fixo para os adicionais, na adição dos itens, informe o valor do frete no primeiro item e nos demais informe 0 ( zero ). Pronto, agora ele vai aceitar lá como valor de frete o que você informou.
Para calcular o frete direto com o webservice dos Correios/ECT com PHP use a biblioteca que peguei do iMasters e adaptei ( refatorei várias coisas e adicionei funcionalidades ) aqui: https://github.com/silasrm/correios
